המרכז ללשונות היהודים וספרויותיהם מקיים אחת לשנתיים או לשלוש שנים כינוס מדעי בינלאומי בהשתתפות בכירי החוקרים בתחום הזה מן הארץ ומחוצה לה ואף דוקטורים צעירים ודוקטורנטים. הכינוסים הבינלאומיים של המרכז, הנושאים אופי של סדנת מחקר ונמשכים ארבעה ימים, נערכים בקמפוס הר הצופים באוניברסיטה העברית בירושלים. הכינוסים הללו הם מן האירועים המרכזיים בעולם בתחום לשונות היהודים החדשות.
בכינוסים האלה נדונות לשונות יהודים שונות ובכללן: לאדינו (ג'ודזמו, ספרדית יהודית), ערבית יהודית (במזרח, במערב ובתימן), יידיש, ארמית יהודית, איטלקית יהודית, פרובנסאלית יהודית, לשון יהודי גיאורגיה, מאליאלאם, אנגלית יהודית ויוונית יהודית.